電子標識データを用いた魚類の移動経路(経緯度)推定手順

  
 このページでは,記録型電子標識(アーカイバルタグ)に記録された照度,水温,深度を利用した経緯度推定・補正の一連の処理について,既存のRのパッケージを用いた方法を解説しています。解析処理に用いたRのプログラムコードは以下からダウンロード可能です。使用に関するご不明点等はかつおグループにお問い合わせください。

1. 概要説明スライド(ファイルサイズ40MB)

2. Rコード(Windows用)

  Rコード(Mac用)
正誤表


このページの元となる技術報告論文
木下順二・青木良徳・岡本 俊・藤岡 紘・清藤秀理(2019,印刷中,第11巻2号予定)照度付き記録型電子標識(アーカイバルタグ)を用いた魚類の経緯度推定手順と実践上の注意点.水産技術.(リンクURL掲載予定)


参考文献
経緯度推定した研究
Aoki Y,Kitagawa T,Kiyofuji H,Okamoto S,Kawamura T(2017)Changes in energy intake and cost of transport by skipjack tuna(Katsuwonus pelamis) during northward migration in the northwestern Pacific Ocean. Deep Sea Res.,Part II,140,83–93.(https://doi.org/10.1016/j.dsr2.2016.05.012

Fujioka K,Masujima M,Boustany AM,Kitagawa T(2015)Horizontal movements of Pacific bluefin tuna(Chapter 5). In: Kitagawa T,Kimura S(eds.),Biology and Ecology of Bluefin Tuna. CRC Press Taylor & Francis Group,Boca Raton,London,New York. 101–122. (https://www.crcpress.com/Biology-and-Ecology-of-Bluefin-Tuna/Kitagawa-Kimura/p/book/9781498724876

Fujioka K,Fukuda H,Furukawa S,Tei Y,Okamoto S,Ohshimo S(2018a)Habitat use and movement patterns of small(age-0) juvenile Pacific bluefin tuna (Thunnus orientalis) relative to the Kuroshio. Fish. Oceanogr.,27,185–198. (https://doi.org/10.1111/fog.12244

Fujioka K,Fukuda H,Tei Y,Okamoto S,Kiyofuji H,Furukawa S,Takagi J,Estess E,Farwell CJ,Fuller DW,Suzuki N,Ohshimo S,Kitagawa T(2018b) Spatial and temporal variability in the trans-Pacific migration of Pacific bluefin tuna(Thunnus orientalis)revealed by archival tags. Prog. Oceanogr.,162,52–65. (https://doi.org/10.1016/j.pocean.2018.02.010

Furukawa S,Fujioka K,Fukuda H,Suzuki N,Tei Y,Ohshimo S(2017)Archival tagging reveals swimming depth and ambient and peritoneal cavity temperature in age-0 Pacific bluefin tuna, Thunnus orientalis,off the southern coast of Japan.  Environ. Biol. Fishes,100,35–48. (https://doi.org/10.1007/s10641-016-0552-3

Hokimoto T and Kiyofuji H(2014) Effect of regime switching on behavior of albacore under the influence of phytoplankton concentration.Stoch.Environ.
Res.Risk.Assess.,28,1099-1124.(https://doi.org/10,1007/s00477-013-0816-9)

Kiyofuji H,Aoki Y,Kinoshita J,Okamoto S,Masujima M,Matsumoto T,Fujioka K,Ogata R,Nakao T,Sugimoto N,Kitagawa T(in press) Northward migration dynamics of skipjack tuna(Katsuwonus pelamis) associated with the lower thermal limit in the western Pacific Ocean.Progress in Oceanography.(https://doi.org/10.1016/j.pocean.2019.03.006

電子標識を用いた研究
岡本俊・清藤秀理・竹井光弘・福田漠生・石川洋一・五十嵐弘道・増田周平・杉浦望実(2013)アーカイバルタグデータに基づいた冬季北太平洋亜熱帯海域でのカツオ当歳魚の鉛直遊泳行動と生息環境.水産海洋研究,77,155–163.(http://www.jsfo.jp/contents/77-3.html

問い合わせ先
  国際水産資源研究所 かつお・まぐろ資源部 かつおグループ
  TEL:054-336-6043
  Email:NRIFSF-SKJG@ml.affrc.go.jp